Die drei Aargauer Landeskirchen führen ihre gemeinsamen Arbeitsfelder durch verschiedene ökumenische Kommissionen wie die ökumenische Kommission für kirchliche Arbeit an kantonalen Schulen, die ökumenische Kommission für katechetische Aus- und Weiterbildung im Aargau oder die ökumenische Begleitkommission Palliative Care und Begleitung.
Ökumenische Kommission für kirchliche Arbeit an kantonalen Schulen (KAS)
- Präsidium: Barbara Stüssi-Lauterburg (reformiert)
- Reformierte Mitglieder: Stephan Girod, Karl Kürtös, Stefan Mayer, Monika Thut Birchmeier
- Römisch-katholische Mitglieder: Urs Bisang, Tobias Fontein, Michael Jablonowski, Sara Folloni (ein Sitz ist vakant)
- Vertretung Beauftragte: Bärbel Hess Bodenmüller, Tamar Jenny, Peter Lötscher, Benjamin Ruch, Christine Stuber, Martin Zürcher
Ökumenische Begleitkommission der Fachstelle Religion am Campus Brugg-Windisch
- Präsidium: Michael Jablonowski (katholisch)
- Reformierte Mitglieder: Mathias Bänzinger, Stephan Degen-Ballmer, Stefan Mayer, Barbara Stüssi-Lauterburg
- Römisch-katholische Mitglieder: Urs Bisang, Mirjam Duff, Isabelle Senn
Ökumenische Kommission für katechetische Aus- und Weiterbildung im Aargau
- Präsidium: Barbara Stüssi-Lauterburg (reformiert)
- Reformierte Mitglieder: Jürg Hochuli, Stephan Degen-Ballmer
- Römisch-katholische Mitglieder: Tobias Fontein, Joachim Köhn, Carsten Mumbauer
Schulkommission der Ökumenischen Kirchenmusikschule Aargau (KMSA)
- Präsidium: Andrea Libardi
- Reformierte Mitglieder: Christian Bieri, Nathalie Leuenberger Schmid
- Römisch-katholische Mitglieder: Hanna Mehl, Nadia Omar
Ökumenische Begleitkommission Palliative Care und Begleitung
- Präsidium: Catherine Berger-Meier (reformiert)
- Reformierte Mitglieder: Jürg Hochuli
- Römisch-katholische Mitglieder: Stefan Hertrampf, Hans Niggeli, Martin Rotzler
- Christkatholische Mitglieder: Antje Kirchhofer
- Weitere Mitglieder: Dieter Hermann (Hospiz Aargau), Monika Koch (Vertretung Regionalgruppe)
Strategisches Leitungsgremium der ökumenisch verantworteten Seelsorge in Institutionen des Gesundheitswesens im Kanton Aargau (övSeSo)
- Reformierte Mitglieder: Catherine Berger-Meier, Stefan Mayer
- Römisch-katholische Mitglieder: Hans Niggeli, Martin Rotzler