Die Reformierte und die Römisch-Katholische Landeskirche sind im Aargau an den verschiedenen Kantonsschulen in ökumenischer Zusammenarbeit tätig. Sie haben Lehrbeauftragte an den Kantonsschulen in Aarau (Alte und Neue Kantonsschule), Baden, Wettingen, Wohlen und Zofingen. Die reformierten Lehrbeauftragten finden Sie unten.
Im Vordergrund steht die Unterrichtstätigkeit im Freifach «Religion» und die Seelsorge. Daneben finanzieren Landeskirchen und Kanton gemeinsam das Freifach «Hebräisch». Das Ergänzungsfach «Religionslehre» hingegen wird vollumfänglich von den Schulen verantwortet und bezahlt, jedoch von den kirchlichen Beauftragten erteilt.